Dobrý den,
v případě zřizovacích nákladů dáváte většinou nákladové položky na účet 381 - náklady př.období. Následně po zápisu do OR je rozpouštíte do daňově uznatelných nákladů. Ve Vašem případě, by tedy nájem za 07,08 a zřejmě i 09 byly z účtu 381 rozpuštěny po zápisu jako uznatelný náklad. Následně je více možností, ale já se přikláním k rozpuštění účtu 381 vždy na konci účetního období. Tzn. 10,11,12/2011 rozpustit do nákladů k 31.12.2011 a 1-6/2012 rozpustit k 31.12.2012.
V druhém případě, když zřizovací náklady dáte do dlouhodobého majetku, je nutné je odepisovat. Předchozí odstavec tím nemusíte řešit.